Neue Rolle bei der räumlichen chromosomale Organisation identifiziert, für die oft mutierte Krebs-protein: ARID1A-Steuerelemente, wie das Genom ist räumlich organisiert im Zellkern zu koordinieren Genexpression

Neue Forschungsergebnisse aus Dem Wistar-Institut wirft ein Licht auf die Funktion der ARID1A-protein, kodiert durch ein gen, das zu den am häufigsten mutierte über die menschliche Krebsarten. Laut der Studie, online veröffentlicht in der Wissenschaft Fortschritte, ARID1A spielt eine Rolle in der räumlichen Organisation des Genoms; deshalb ist sein Verlust hat weitreichende Auswirkungen auf die Globale Genexpression. Dieser Befund fügt kritische Informationen in Richtung der Entschlüsselung der molekularen Veränderungen im Zusammenhang mit diversen Krebs-Arten und besonders mit Eierstockkrebs.

„Mein Labor ist die Untersuchung der Rolle der ARID1A in der gen-Ausdruck-Verordnung als Teil einer komplexen, bekannt als SWI/SNF“, sagte principal investigator Rugang Zhang, Ph. D., stellvertretender Direktor Der Wistar-Institut-Krebs-Mitte und professor und co-Programmleiter der Genexpression und der Verordnung Programm. „Bei unserer Suche nach neuen interagierenden Proteinen des Komplexes, den wir entdeckt haben, bietet neue Perspektiven auf die Funktion der ARID1A, wie ein Genom-weiten regulator der Geo-Chromosom Organisation.“

Die dreidimensionalen Organisation des Genoms bestimmt, wie mehrere Meter Wert der DNA-Moleküle, verpackt in einer mikroskopischen Raum, während auch so dass jeder gen werden zugänglich für die Transkription und expression in der entsprechenden Zeit. Das team fand heraus, dass ARID1A interagiert mit einer Komponente des kondensierend Abmessungen in mm (II-Komplex, reguliert die Genexpression durch die Organisation von Chromosomen-Struktur.

„Dies ist ein fein regulierter Prozess, und wir zeigten, dass ARID1A eine entscheidende Rolle“, ergänzt Zhang.

Ergebnisse zeigten, dass die ARID1A diktiert die Genom-weite Positionierung kondensierend Abmessungen in mm (II auf bestimmten regulatorischen DNA-Elemente, sogenannte Enhancer. Daher, wenn ARID1A Funktion verloren als Folge der gen-mutation, kondensierend Abmessungen in mm (II Verteilung verändert wird, und so ist die expression einer Vielzahl von Genen.

Zhang und Kollegen ergab auch, dass, durch seine Interaktion mit kondensierend Abmessungen in mm (II, ARID1A steuert, wie verschiedene Teile der Chromosomen sind räumlich organisiert, gemeinsam in Regionen, die bekannt sind als Chromosomen-Territorien, die die koordinierte expression bestimmter Gruppen von Genen.

„Unsere Ergebnisse fügen Sie eine wichtige Arbeit auf dem Gebiet der chromatin-regulation in cancer“, sagte Shuai Wu, Ph. D., co-erste Autor der Studie und Postdoktorand in der Zhang Lab. „Durch die Veränderung der besonderen Organisation der Chromosomen, ARID1A Verlust zu erwarten ist, haben viel breitere Auswirkungen auf die Genexpression als wir ursprünglich gedacht haben.“