Sutter, UPMC und DNAnexus forge precision medicine partnership

Sutter-Gesundheit und der biomedizinischen informatik und Daten-management-DNAnexus sind die Partnerschaft auf eine Studie zur Verbesserung personalisierter Therapien für Menschen mit multipler Sklerose. Als Teil der Partnerschaft, die Genome Center der University of Pittsburgh Medical Center (UPMC) generiert clinical-grade genomische Daten aus den Proben beigetragen haben, indem Sie die Programm-Teilnehmer.

WARUM ES WICHTIG IST

Wissenschaftler an Sutter ‚ s Center for Precision Medizin-input-de-identifiziert clinico-genomic Datensätze von mehr als 3.000 Patienten zu DNAnexus Apollo-Plattform für die Analyse und Visualisierung, sowie zur Unterstützung der Zusammenarbeit.

In der Studie der ersten phase von 500 Patienten, ab dem nächsten Monat werden Wissenschaftler sammeln, electronic health record-EHR-Daten, Patienten-berichtete Ergebnisse, die imaging-Daten und Blutproben, als auch von ganzen exome sequencing (WES) erfolgt durch UPMC.

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Dann DNAnexus team Prozess WES-Daten durch Analyse-pipelines und verknüpfen Sie die resultierende genetische Daten mit klinischer Daten auf Apollo.

Die Sutter-Gesundheit-team, kann dann mit Apollo zu beurteilen, die Patienten der klinischen und genomischen Eigenschaften korrelieren mit MS-Subtypen, sowie Behinderung Fortschreiten, Inszenierung, Symptome, MRT-Veränderungen und differenzierte Antwort auf krankheitsmodifizierende Therapien (DMTs).

AUF DER PLATTE

„Unser Zentrum bietet eine Umgebung zur Erzeugung von hochwertigen genomischen Daten für Sutter-Gesundheit und die seiner Patienten“, UPMC Genome Center director Annerose Berndt sagte in einer Erklärung.

Das Genom-Zentrum hat die Kapazität zur Unterstützung von high-volume-Klinik und Forschung-Sequenzierung für eine Vielzahl von Anwendungen, einschließlich whole genome sequencing, WES, und der bulk-und single-cell-RNA-Sequenzierung, die mit der Datenverarbeitung und-Speicherung unterstützt durch die cloud-basierte Infrastruktur.

„Dies ist ein wichtiger Schritt, um die Voraus-Präzision Medizin die Anstrengungen auf Sutter und letztlich auf die Verbesserung der Therapien für Menschen mit MS in unserer community und den Millionen von betroffenen mit der Krankheit weltweit,“ Gregory Tranah, Direktor des Zentrums für Präzisions-Medizin bei Sutter Health, Hinzugefügt die Anweisung.

DER GRÖßERE TREND

Im vergangenen Jahr Microsoft und GV (ehemals Google Ventures) kündigte eine Investition in DNAnexus, als es geschlossen auf $58 Millionen Finanzierungsrunde mit Investitionen im Januar 2018.

Die Investition kommt als mehr und mehr große Technologie-Anbieter machen werden bewegt sich in den Bereichen Genomik, Bioinformatik und Präzision Medizin und Krankenhäuser IT-Abteilungen sind zunehmend mit der Aufgabe, die Einbindung in die Arzt-workflow.

DNAnexus startete die Mosaik-Mikrobiom-Plattform, die ein besseres Verständnis des menschlichen microbiome und einer early-access-Programm für Google Gehirns, Tiefe Variante-Technologie. Das Unternehmen kündigte außerdem separate Kooperationen mit AstraZeneca Center for Genomics Forschung und Rady Children ‚ s Institute für Genom-Medizin.

Nathan Eddy ist ein healthcare-und Technologie-freelancer mit Sitz in Berlin.

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